乙状结肠镜可用于检查有直肠或肛门症状（如肛门新鲜出血，溢液，脱出，疼痛）的患者，评价内镜可达范围内的病变，在肛门直肠手术前检查直肠或乙状结肠。无绝对禁忌证。对心律不齐或近期患心肌缺血的患者可延期至情况改善后或在心脏监护下进行检查。对有瓣膜心脏病患者可应用抗生素预防心内膜炎。
对肛门周围或远端直肠的检查可采用7cm肛门镜，整个直肠的检查可采用25cm或60cm可弯曲内镜。可弯曲乙状结肠镜的费用较硬式镜约高一倍，但患者较舒服并容易进行照相，活检及细胞学检查等。
可弯曲乙状结肠镜检查方法与下述的结肠镜检查相同，但无需静脉注射药物，而且操作更简便，可予磷酸盐灌肠剂使直肠排空。采取硬式乙状结肠镜检查时，患者常取膝胸位。在直肠指诊后检查肛门周围，然后将涂有润滑油的镜筒轻柔地通过肛门括约肌推进3~4cm，取出闭空器，在直视下将镜筒继续推进，在镜筒通过直肠乙状结肠结合处（15cm）时为避免引起患者的不适，操作者需要相当熟练的技巧。应用肛门镜检查时，患者通常采取左侧卧位，应将全部长度的肛门镜插入。若操作适当，极少发生并发症。
