真菌性肠炎，主要由白色念珠菌寄生于肠粘膜引起炎症而致病。但在下列情况时易继发本病：①当机体患严重肝肾疾病、粒细胞缺乏症、或恶性肿瘤时引起恶质体，均可导致机体免疫功能降低。如长期使用抗生素、肾上腺皮质激素、化学抗癌药物、免疫抑制剂和放疗等皆可使机体和组织的抗病能力减弱，或肠道菌群失调，真菌乘虚而入，大量繁殖，侵袭组织而易引起肠道真菌病。②真菌性肠火炎还是继发于消化道某些疾病，如痢疾、肠梗阻、食道脓中等。由于这些疾病破坏了肠道粘膜的完整性，给真菌的侵入创造了条件。
真菌性肠炎，可发生于任何年龄，但以体质差、营养不良，或患有鹅口疮的婴幼儿及抵抗力低下的儿童多见。
