肛门直肠的局部解剖和排便控制机理是个复杂问题。新生儿肛管长度1．2cm（0．8～2cm），直肠长度5．2cm（3．5～7．5cm），近肛门处存在前凸的直肠会阴曲，肛管纵轴与会阴平面交角85°（60～90°）。腹膜反折距肛门约2．9cm（2～4cm），骨盆神经从位于骶前距肛门约3cm。直肠末端的环肌束向下延伸并增厚形成的括约肌，是平滑肌，呈不自主的收缩状态，以闭合肛门。环绕直肠的外括约肌是横纹肌，可随意志而收缩，包括尖顶袢、中间袢和基底袢三个肌群。肛外括约肌与耻骨直肠肌应视为一个统一体，共同构成控制排便的三个重要肌环，称为三环系统 （triple loop system）。具有直接反向压迫作用和绞锁机制，对肛门进行有力的控制。三环袢完全损伤，即导致肛门失禁。在肛管盲肠畸形时，各肌纤维发育不正常，纤维走向亦有改变。外括约肌包括耻骨直肠肌肌纤维称为横纹肌复合体（striated muscular co mplex），以利手术进行。直肠耻骨肌在直肠肛管交接处形成一个环状吊带，称为耻骨直肠环（Pubo-rectl sling），收缩时增加直肠下段的压力，起到排便的控制作用。盆腔肌左右两束肌群总称肛提肌，形成小骨盆腔内协调的收缩作用，帮助排便。联合纵肌是内、外括约肌间的纤维性组织，起固定肛管作用并协助排便。肛管直肠畸形手术时，应尽量保持肛门直肠周围肌群的完整性，以获得较完善的排便功能。