由于BV是以阴道生态环境紊乱为特征，故BV的治疗是针对BV相关混杂微生物（主要是阴道加德纳菌、厌氧菌）的过度生长和产H2O2乳酸杆菌减少的情况，通过全身系统治疗或阴道局部治疗而达到杀灭致病物并恢复产H2O2乳酸杆菌占优势的阴道菌丝，从而恢复正常的阴道生态环境的目的。此外，由于BV复发率高，治疗后随访很重要，一般治疗后1、3、4、9月各复诊一次。BV治疗期间应避免性生活或使用避孕套，局部治疗期间还应避免长时间的盆浴。治疗结束后4周内性生活亦需使用避孕套。

　　1、全身用药首选甲硝唑400mg，每日2-3次口服，共7日；或甲硝唑2g，单次口服；或克林霉素300mg，每日2次，连服7日。近期有效率达82％～97％。

　　2、阴道用药甲硝唑栓剂、2％克林霉素软膏每天一次，共七天，或用1％乳酸液或0.5％醋酸液冲洗阴道，改善阴道内环境以提高疗效。

　　3、特殊治疗由于BV可能与一系列妊娠并发症有关，如胎膜早破、早产、绒毛膜羊膜炎、羊水感染等，故应密切随访。一般认为患BV的孕妇可局部使用甲硝唑、氯林可霉素治疗，也可口服氯林可霉素及氨苄青霉素，用法同前，但妊娠头3个月内禁服甲硝唑；男性伴及无症状患者的治疗 对于无症状的BV及BV的男性伴一般不主张常规治疗，但对反复发作或难治的BV患者，其男性伴应接受治疗；无症状的BV患者在接受子宫内膜活检、宫腔镜检查、放置宫内节育器、人工流产等操作术前，应进行全身治疗，以减少术后并发症。