沙眼（椒疮）重症的并发症与后遗症较多，古人早已发现并有详述，只是限于条件，尚未将这些并发症和后遗症与沙眼联系在一起阐述。现概述如下。
一、倒睫拳毛沙眼后期，睑内结瘢，瘢痕牵扯，内急外弛，睑弦内翻，拳毛触刺睛珠，羞明流泪，沙涩疼痛，甚至白睛红赤，黑睛生翳，视物昏朦。
二、血翳包睛邪毒侵及黑睛，轻者赤脉如帘，由上垂下，称为赤膜下垂；重者由黑睛四周侵入，致黑睛混赤，称为血翳包睛。睛珠涩痛，羞明流泪，视物昏朦。
三、黑睛星翳赤脉下垂者，在赤丝尽头出现星点云翳。重者可变生花翳白陷或凝脂翳。
四、睥肉粘轮毒邪损及胞睑内面与白睛表层，致使睑内面与白睛粘着。牵引胞睑时，可见睑内与白睛相连。重者阻碍眼珠转动。
五、流泪症与漏睛症邪毒侵及泪窍，使窍道受阻，泪液不得下渗则可溢于睑外。若排泪窍道邪毒煎熬，日久又可腐败成脓，变生漏睛。
六、睛珠干燥邪毒久郁，阴液耗损，目失濡养，白睛少津，故跟干涩不舒，频频眨目。严重者，可干燥变厚似皮肤。黑睛干燥生翳，视物昏朦，甚至盲不见物。
七、上胞下垂邪毒壅盛，脉络瘀阻，胞睑肿硬变厚，致上胞重坠难举，或病变累及提睑筋肉而无力提举。
