造血干细胞主要存在于骨髓中，这是它们最丰富的来源。此外，造血干细胞也可以在脐带血和外周血中找到。在特定条件下，如给予某些细胞因子或药物刺激后，部分造血干细胞可以从骨髓释放到血液循环中，使得外周血成为采集这些细胞的另一个途径。脐带血中的造血干细胞则是在新生儿出生时从脐带和胎盘中收集得到的。
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