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1、肠道规律性排便的生理基础是肠道规律性运动，包括合适的强度、节律与方式以及时间。某些药物或作用于支配胃肠道运动的神经，将其抑制，或作用于胃肠道肌肉收缩机制的不同环节，使肌肉“软瘫”。
2、促进肠内容物中水分的吸收。它们或使水分进入体内，或被药物吸收，水分少了，粪便干结，对肠道的刺激削弱了，从而引起便秘。
3、正常菌群平衡的破坏。正常排便需医|学教育网搜集整理要肠道内有一个平衡的菌群，占绝对优势的有益菌群（如双歧杆菌等）与有害菌（如梭状芽孢菌）之间种类、数量的平衡（不是均等）。一些药物，尤其是抗生素类药物，可以破坏这种生态平衡，抑制了有益菌，以致有害菌猖獗，也可导致便秘。
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