妊娠期合并沙眼衣原体（Chlamydia trachomatis, CT）感染的治疗非常重要，因为这种感染不仅会影响孕妇自身的健康，还可能对胎儿造成不良影响。在选择治疗方法时，需要考虑到药物的安全性以及疗效。

常用的治疗方案包括：
1. 阿奇霉素：妊娠期妇女首选阿奇霉素进行治疗。一般推荐剂量为单次口服1g。对于耐药或者复发的情况，可以考虑增加疗程至3-5天，每日一次，每次250mg-500mg。
2. 红霉素或琥乙红霉素：如果患者对阿奇霉素过敏，则可以选择使用红霉素或者其衍生物琥乙红霉素作为替代治疗。推荐剂量为每天4次，每次250mg-500mg，连续服用7天。
3. 多西环素和四环素类药物在妊娠期间不建议使用，因为它们可能会对胎儿的骨骼发育产生不良影响，并且可能导致牙齿变色等问题。
4. 治疗过程中需要注意个人卫生，避免性行为直至感染完全治愈。同时，患者的性伴侣也应接受检查及必要的治疗，以防止交叉感染或重复感染。
5. 完成疗程后1-2周内需要复查，确保感染已经彻底清除。如果初次治疗失败，则需重新评估并选择其他有效的抗生素进行治疗。

在具体应用时，请根据患者的具体情况和医生的专业指导来确定最合适的治疗方案。