甲状腺发育不良是引起先天性甲状腺功能减低症（先天性甲减）的一个重要原因。在胎儿期，如果甲状腺没有正常地形成或迁移到正确的位置，或者虽然形成了但未能发展成具有足够功能的腺体，就会导致出生后甲状腺激素分泌不足。具体来说：
1. 甲状腺未发育：有的胎儿在胚胎早期阶段，甲状腺原基未能正常分化和发育，导致出生时完全没有一个可以工作的甲状腺。
2. 甲状腺异位：正常情况下，甲状腺应该位于颈部前方，但是由于迁移过程中的异常，部分婴儿的甲状腺可能停留在其他部位（如舌根部），这种位置上的错误会影响其功能发挥。
3. 甲状腺组织缺陷：即使有甲状腺存在，但如果腺体内细胞数量不足、结构异常或合成代谢途径受损等，也会造成分泌的甲状腺激素量不足以满足机体需要。
当新生儿因为上述任何一种原因而缺乏足够的甲状腺激素时，就会出现生长发育迟缓、智力障碍等一系列症状，这就是先天性甲减。早期诊断和及时补充外源性甲状腺素是治疗该病的关键措施。
