先天性甲状腺功能减退，也称为克汀病或呆小症，主要是由于胎儿期甲状腺发育不良、异位、甲状腺激素合成障碍或者母体在怀孕期间摄入的碘不足等原因导致。具体来说：
1. 甲状腺不发育或发育不全：这是最常见的原因，指的是婴儿出生时完全没有甲状腺或是甲状腺没有正常形成。
2. 甲状腺位置异常（异位）：有时候甲状腺组织可能在错误的位置生长，影响其功能发挥。
3. 遗传因素：某些遗传缺陷可以干扰甲状腺激素的合成过程。例如，过氧化物酶缺乏症和碘代谢障碍等都属于这种情况。
4. 母体因素：如果母亲自身存在抗甲状腺抗体或者孕期严重缺碘，也可能会影响到胎儿的甲状腺功能。
5. 其他罕见原因还包括药物影响、感染等因素导致的新生儿暂时性甲减。
这些因素单独或联合作用均可引起先天性甲状腺功能低下。早期诊断和治疗对于避免长期并发症至关重要。
