肾功能不全导致呼吸困难的原因是多方面的，主要可以从以下几个方面来理解：
1. 水钠潴留：肾脏功能减退时，排泄体内多余水分和钠的能力下降，容易造成水钠潴留。过多的液体可以进入肺组织间隙或肺泡内，形成肺水肿，影响气体交换过程，从而引起呼吸困难。
2. 酸碱平衡失调：肾功能不全患者常常伴有代谢性酸中毒，这种情况下血液中的二氧化碳分压升高，刺激呼吸中枢过度兴奋，导致呼吸急促、气短等症状出现。
3. 贫血：慢性肾脏疾病常伴随贫血现象，红细胞减少使得携氧能力下降，组织缺氧加重，心脏为了补偿这一状况会加快跳动频率以增加氧气供应量，但同时也增加了对肺部的需求，进而引发或加剧呼吸困难。
4. 心力衰竭：肾功能不全晚期可并发心力衰竭，此时心脏泵血效率降低，回心血流量减少，导致静脉系统压力增高，进一步加重了肺循环负担，可能诱发急性左心衰竭而产生严重的呼吸困难。
5. 尿毒症性肺炎：尿毒素在体内积累到一定程度后，可能会对肺部造成直接损害，引起化学性的炎症反应，表现为咳嗽、咳痰甚至出现呼吸困难等症状。

因此，在肾功能不全患者中观察到的呼吸困难症状可能是上述多种因素共同作用的结果。对于此类患者的管理需要综合考虑其具体病情，并采取相应的治疗措施以缓解症状。