中枢神经系统的感染可以由多种病原体引起，包括细菌、病毒、真菌和寄生虫。常见的病原体有：
1 细菌性脑膜炎的常见致病菌包括肺炎链球菌（特别是儿童和成人）、B型流感嗜血杆菌（主要在未接种疫苗的儿童中）、脑膜炎奈瑟菌（引起流行性脑脊髓膜炎）等。
2 病毒性脑炎或脑膜炎常见的病毒有肠道病毒、单纯疱疹病毒1型（HSV-1，可导致严重的脑炎）、水痘带状疱疹病毒、EB病毒以及一些虫媒病毒如日本脑炎病毒和西尼罗河病毒等。
3 真菌性感染相对少见，但免疫功能低下的患者更容易发生。常见的真菌包括新生隐球菌（引起隐球菌性脑膜炎）、念珠菌属、曲霉菌属等。
4 寄生虫引起的中枢神经系统疾病也不罕见，如弓形虫病可导致脑炎或占位病变；囊尾蚴病可以形成脑囊虫病；阿米巴原虫中的福氏耐格里阿米巴能引起急性坏死性脑膜脑炎等。
这些只是部分常见的致病微生物，在临床诊断时还需要结合患者的流行病学史、临床表现及实验室检查结果来确定具体的感染源。
