在某些情况下，母体的免疫系统可能会产生针对自身或胎儿甲状腺组织的抗体，这些抗体会通过胎盘进入胎儿体内，进而影响到胎儿甲状腺的功能。具体来说，母体产生的抗甲状腺过氧化物酶（TPO）抗体或者抗甲状腺球蛋白（TG）抗体等，可能与胎儿的甲状腺细胞表面受体结合，导致其功能受损或破坏。

此外，还有一种情况是母体产生的是刺激性抗体，如针对促甲状腺激素受体（TSHR）的刺激性抗体，这种情况下，抗体模拟了TSH的作用，可能导致新生儿出现短暂性的甲亢症状。但是，当提到干扰胎儿甲状腺激素合成时，更多的是指那些抑制性或破坏性的抗体会对胎儿产生不利影响。

这些母源性抗体通过胎盘进入胎儿血液循环后，可以与胎儿的甲状腺细胞发生作用，干扰正常的甲状腺激素合成过程，包括但不限于影响碘摄取、氧化及有机化等关键步骤。如果这种干扰持续存在且程度严重，则可能导致胎儿或新生儿出现先天性甲状腺功能减退症（也称为克汀病），表现为生长发育迟缓、智力障碍等症状。

因此，在孕期管理和产前检查中，对于有自身免疫性甲状腺疾病史的孕妇，医生通常会更加关注其血清中的抗体会否对其胎儿造成不良影响，并采取相应的监测和干预措施。