排斥反应在骨科移植中主要是由于免疫系统对移植物的识别和攻击引起的。具体来说，当患者接受异体骨移植时（即从另一个个体获取的骨头），患者的免疫系统可能会将移植的骨骼视为“外来物”。这是因为供体与受体之间的组织相容性抗原（主要为人类白细胞抗原HLA）存在差异。如果这些抗原不匹配或部分匹配，受者的免疫系统就会产生针对移植物的免疫应答，导致排斥反应的发生。
这种免疫应答可以是细胞介导的，也可以是抗体介导的，或者两者兼有。在细胞介导的情况下，T淋巴细胞会直接攻击移植组织；而在抗体介导的情形下，则是因为B淋巴细胞产生了对抗供体抗原的特异性抗体，这些抗体会与移植物表面的抗原结合，引发一系列炎症反应和损伤。
因此，在进行骨科移植手术前，通常需要尽量选择HLA配型相匹配的供体，并且术后给予患者免疫抑制剂以减少排斥风险。
