小儿免疫系统发育不全主要表现在以下几个方面：
1. 免疫器官和组织发育不完善 新生儿及小婴儿的胸腺、淋巴结等免疫器官尚未完全成熟，导致其免疫功能相对较弱。
2. 细胞免疫功能低下 婴幼儿T细胞数量较少且功能不健全，尤其是CD4 T辅助细胞的功能较成人低，这直接影响到机体对病毒、真菌及某些细菌感染的抵抗能力。
3. 体液免疫反应迟缓 新生儿出生时虽可从母体获得IgG类抗体，但自身产生特异性抗体的能力较差，B淋巴细胞分泌各种类型免疫球蛋白的能力不足，使得婴幼儿易患呼吸道和消化道等部位的感染性疾病。
4. 吞噬细胞功能不全 婴幼儿体内中性粒细胞、巨噬细胞的数量及活性均低于成人水平，这将影响机体对病原微生物尤其是胞内寄生菌的清除效率。
5. 补体系统发育滞后 新生儿血清中的补体量较少且活性较低，这对增强抗体依赖性和非特异性免疫反应有不利影响。
6. 免疫调节机制不成熟 婴幼儿体内Th1/Th2细胞因子平衡失调，导致其对某些抗原刺激的应答偏向性异常，从而增加过敏性疾病和自身免疫病的风险。

综上所述，小儿免疫系统发育不全在多个层面都存在缺陷，因此需要家长和社会给予特别关注与保护。