新生儿感染的主要病原体包括细菌、病毒和真菌等。常见的细菌性病原体有大肠杆菌、B群链球菌（GBS）、金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌以及李斯特菌等。这些细菌可能导致新生儿出现败血症、脑膜炎或肺炎等症状。
病毒方面，巨细胞病毒（CMV）、单纯疱疹病毒（HSV）、呼吸道合胞病毒（RSV）和腺病毒是比较常见的病原体，它们可以引起多种症状，从轻微的发热到严重的肺部感染或神经系统损害不等。
真菌中，念珠菌是最常导致新生儿感染的一种，尤其是早产儿或免疫功能低下的婴儿更容易受到感染。念珠菌感染可能表现为口腔鹅口疮、皮肤感染或是更严重的情况如血液感染。
此外，还有一些其他少见但重要的病原体也可能引起新生儿感染，这取决于具体的临床环境和暴露风险因素。对于新生儿来说，预防措施非常重要，包括产前筛查母亲的感染情况、保持良好的个人卫生习惯以及在医院环境中采取严格的消毒和隔离措施等。
