结核杆菌主要通过空气飞沫传播，当一个患有活动性肺结核的人咳嗽、打喷嚏、说话或唱歌时，可以将含有结核杆菌的微小液滴释放到空气中。其他人如果吸入了这些带有病菌的微粒，则有可能被感染。此外，虽然比较罕见，但结核杆菌也可能通过其他途径如饮用受污染的牛奶（牛型结核分枝杆菌）而传播。
鼠疫耶尔森菌主要通过跳蚤叮咬和直接接触感染动物的组织或体液来传播给人类。当携带病原体的跳蚤从感染了鼠疫的啮齿类动物身上吸血后，再叮咬人类时就可能将细菌传给被咬者。此外，处理患病或死亡的动物（尤其是野兔、土拨鼠等）也可能导致人直接接触感染。在极少数情况下，如果吸入含有鼠疫耶尔森菌的飞沫颗粒，也可以引起肺部感染即原发性肺鼠疫。
