（1）胆汁淤积，久之肝硬化。
（2）门静脉高压
1）巨大囊肿压迫门静脉引起肝外型门静脉高压，内引流术可缓解。
2）晚期肝硬化引起肝内门静脉高压。预后较差。
（3）胆系感染：反复发作胆管炎、胆囊炎，使抵抗力下降。
（4）胰腺炎：胰胆合流异常，引起急慢性胰腺炎，胰管扩张。
（5）胆系结石形成；长期胆汁淤滞、感染的结果。
（6）胆总管穿孔：囊内压力加大，在囊壁薄弱处穿孔，好发部位多在胆囊管与胆总管交界处附近，穿孔后可引起急性胆汁性腹膜炎。
（7）囊肿壁癌变：由于炎症、溃疡、胰液刺激、再生或化生的基础上引起，预后不良，此病癌变率2.5％～4％。
