室间隔缺损症的预后，因缺损的大小和有无合并肺高压而异。小的室间隔缺损有自然闭合征象者，可以定期检查，暂缓手术；较大的室间隔缺损因肺血流量多，常反复并发肺部感染和心力衰竭，有不同程度的肺高压者，应早期行手术治疗。目前已公认凡伴有肺血管梗阻性病变的患儿，若在2岁以内手术修补，大部分病例的肺血管病变在术后可能好转或消退，可获得良好的生活质量，婴幼儿期行室间隔缺损修补已成为明显趋向。患儿临床症状轻，又无自行闭合可能时，应于3～4岁学龄前根治。临床上已出现明显严重肺高压及发绀时，一般常视为手术禁忌证。
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