病原菌有伊氏放线菌（以色列放线菌），牛放线菌（牛型放线菌），奈氏放线菌（赖氏放线菌），粘放线菌，丙酸放线菌及埃氏放线菌等。引起人类放线菌病常见的病原菌主要是放线菌属中的以色列放线菌、牛型放线菌和赖氏放线菌，还有蛛网膜菌属的丙酸蛛网菌和双歧杆菌属的艾氏双歧杆菌。
感染来源：
内源性，常存在人的龋齿、扁桃体内，在外伤、炎症、拔牙、口腔的外科手术后可引起感染。
外源性，被咬伤引起的原发性皮肤放线菌病。
发病机制：
细菌须通过牙感染、操作或抽吸牙感染碎屑造成的黏膜破损，进入组织，才能致病。可通过吞咽或吸入带菌物质进入胃肠或肺。还可通过下消化道穿孔进入腹腔，医学`教育网搜集整理妇女则可在生殖道发生上行性感染。可通过气管传播。极少数是通过血行播散。
感染后常合并细菌感染，损害由中心逐渐通过窦道，向周围蔓延，侵犯皮肤、皮下组织、肌肉、筋膜、骨骼及内脏等处。
放线菌好侵犯结缔组织，主要发生于颈面部和胸腹器官。但是腹膜抵抗力较强，故腹部放线菌病很少穿过腹膜形成瘘管下。颌骨则易被感染。肌肉和神经很少波及；其他骨骼也很少感染。
