rRNA基因探针是将与rRNA互补的DNA作为探针，该探针的靶序列是rRNA序列。医学教育|网搜rRNA的基因探针的特点是：
①可以增加探针检测的灵敏度，rRNA基因探针可同时检测rRNA分子和DNA分子；
②rRNA具有进化上的保守性；
③杂交方法简便、快速；
④由于rRNA的含量较高，标本不需增菌。美国Gen-Probe公司生产的淋球菌检测探针PACEC，是以rRNA及其基因为检测靶序列，采用放射性标记，在2h内可以完成检测，Peter用这种探针检测395个临床标本，结果灵敏度和特异性分别为92.9%，99.4%，他认为PACEC系统筛查临床标本中淋球菌是一个可靠的方法。该探针还可以检测无症状淋球菌感染者，这是目前培养难于达到的。
