现代医学目前对本病具体形成及发病机理尚不十分清楚，近年来许多学者对其病因主要有以下几种认识：
基因变异：研究发现Atm/c-kit基因变异及其基因产物可引起始基卵泡凋亡和数量减少；
自身免疫：可有多种自身免疫性疾病，医学教育|网搜集最常见的是自身免疫性甲状腺炎，可引起卵巢早衰；
精神压力：精神压力过大会导致内分泌紊乱而引起卵巢早衰；
物理因素：卵巢是很敏感的组织，如果常受到放射线的照射，其功能就衰退得比较早；
过度减肥——相当部分的雌激素保存在脂肪组织中，所以过度减肥或营养不良者，卵巢早衰的危险性比较大。
