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医师资格考试的合格线由卫生部医师资格考试委员会确定，并于每年的11-12月间向社会公告。2016年临床执业医师资格考试医学综合笔试合格分数线公布时间为2016年12月3日，成绩查询入口于12月3日公布，自2016年起临床执业医师考试综合笔试部分执行固定合格分数线，合格分数线为：360分。
2000-2016年临床执业医师资格考试医学综合笔试合格线分数线（临床执业医师综合笔试满分为600分）：
2016年临床执业医师考试分数线360分
2015年临床执业医师考试分数线360分
2014年临床执业医师考试分数线363分
2013年临床执业医师考试分数线356分
2012年临床执业医师考试分数线360分
2011年临床执业医师考试分数线356分
2010年临床执业医师考试分数线351分
2009年临床执业医师考试分数线345分
2008年临床执业医师考试分数线359分
2007年临床执业医师考试分数线350分
2006年临床执业医师考试分数线360分
2005年临床执业医师考试分数线335分
2004年临床执业医师考试分数线328分
2003年临床执业医师考试分数线302分
2002年临床执业医师考试分数线302分
2001年临床执业医师考试分数线334分
2000年临床执业医师考试分数线305分
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