肛管直肠瘘最常见的病因是肛腺感染。当肛腺发生感染后，可以形成脓肿，如果脓肿未能及时得到恰当治疗，可能会进一步发展成为瘘管。此外，其他因素如克罗恩病、放射性损伤、结核等也可能导致肛管直肠瘘的发生，但相对较少见。在临床实践中，了解患者的具体情况对于确定确切病因和制定合理的治疗方案非常重要。
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