有机磷化合物在体内的主要代谢途径包括水解、氧化和结合反应。其中，水解是最主要的代谢方式，通过血浆中的酯酶或肝脏微粒体中的羧酸酯酶将有机磷化合物分解为无毒或低毒性的磷酸产物。此外，部分有机磷化合物还可以被氧化形成更加极性的代谢物，或者与葡萄糖醛酸、硫酸盐等物质结合，以利于从尿液中排出。这些代谢过程有助于减少体内有机磷化合物的毒性，但某些代谢产物仍可能具有一定的生物活性或毒性。
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